В рамках основных направлений Институт осуществляет:
фундаментальные научные исследования по общим и конкретным проблемам отечественной истории;
научные исследования по источниковедению, специальным и вспомогательным историческим дисциплинам;
публикацию источников по истории России;
подготовку научно-справочных изданий;
составление исторических карт и атласов;
разработку учебников, учебных материалов и лекционных курсов по отечественной истории.
За последние пять лет сотрудниками Института подготовлено и издано около 450 книг (общим объемом более 11300 п.л.), в том числе более 200 индивидуальных монографий, более 60 документальных публикаций, около 120 коллективных работ (сборников статей и коллективных монографий), около 50 учебных пособий. Из более чем 2100 научных статей около 430 опубликовано в ведущих отечественных журналах, включенных в перечень ВАК, и около 770 – в академических и международных изданиях (объем – около 1300 п.л.).
Регулярно выходит журнал «Российская история» (в 1957–1992 гг. – «История СССР», в 1992–2009 гг. – «Отечественная история», Институт является соучредителем журнала) и два серийных издания «Труды Института российской истории РАН» и «История и историки. Историографический вестник», включенные в перечень ВАК.