Илья Ильич Мечников родился 3 (по новому стилю – 15) мая 1845 г. в деревне Панасовка Купянского уезда Харьковской губернии. Он был последним ребенком в большой семье Мечниковых. До него в семье родились: сестра Екатерина (1834) и три брата: Иван (1836), Лев (1838) и Николай (1843). Самого младшего сына назвали в честь отца – Ильей. Огромную роль в жизни будущего ученого сыграла его мать Эмилия Львовна Мечникова, урожденная Невахович (1814–1879), – богатая, красивая, живая, редкого ума женщина. Она была дочерью известного русскоязычного польского еврея – Иехуды Лейб Бен Ноаха – литератора, переводчика и бизнесмена, владельца крупного табачного производства на территории Царства Польского (ныне это территория Винницкой и Хмельницкой областей Украины). В 1806 г. он принял лютеранство и стал носить имя Льва Николаевича Неваховича. Эмилия Львовна родилась в 1814 г. в Варшаве и получила домашнее образование. «Она была очаровательна – выдающегося ума, красивого еврейского типа, с чудными темными и огненными глазами, с характером живым, с сердцем добрым и нежным», – вспоминала о ней жена Мечникова – Ольга Николаевна [3. С.4].
По отцовской линии И.И. Мечников – дворянин, а точнее, румынский боярин. Основателем его рода, как и многих других дворянских родов России, был иностранец. В роду Мечниковых это был румын Николай Спафарий (1635/36–1708/09), родившийся в г. Милешты (территория современной Румынии) и получивший образование в Падуе (Италия). Фамилия Мечников ведет начало от племянника Спафария по имени Джордже Штефан Спатарул,