В 1716 г. приобретено собрание «доктора Готвальда, которое большою частью состояло в минералах, раковинах и драгоценных камнях купно с великим числом всяких цветов и видов янтарей, между которыми во многих кусках заключаются насекомые или другие царств животных и растений предметы» [7].
Результатом переписки и путешествий Петра за границу стала покупка в 1717 г. собраний Фр. Рюйша и голландского аптекаря Альберта Себы [8].
Знаменитые тезаурусы профессора Фр. Рюйша были привезены в Санкт-Петербург. И. Бакмейстер писал: «Вещи первого отделения сего собрания простирались сверх 1000 и состояли в зверях, птицах, крокодилах, ящерицах, змеях и других земноводных животных (amphibia); в несчетном множестве насекомых и бабочек; и в собрании нескольких тысяч чужестранных высушенных трав. Второе отделение содержало славные анатомические препараты г. Рюйша, которые искусным их приуготовлением снискали изобретателю онаго бессмертную славу. Петр Великий купил сие собрание за 30 000 гульденов, и приказал доктору Блюментросту перевезти оное в Санкт-Петербург» [9].
Приобретенный кабинет А. Себы представлял собой универсальное собрание. Тут были хранимые в спирте всякие зверьки, рыбы, большая коллекция пресмыкающихся, множество любопытных искусственных вещей: японский кабинет, украшенный ажурной резьбой по слоновой кости, китайская обувь, колчан со стрелами, японская мухобойка, двенадцать римских цезарей из свинца в круглых рамах, микроскоп, фигуры из воска, фигурки зверей, людей и т.д.
Собирались и российские коллекции. Как уже сказано, часть натуралий прибыла из Москвы из Аптекарской канцелярии и была российского происхождения. Дело создания таких препаратов было поставлено Петром I на государственную основу, так же, как и создание госпиталей и госпитальных школ. Россия вела войны, и для лечения раненых необходимы были доктора, которых надо было учить. Так анатомия и хирургия приобретали важное государственное значение.