Общий штат института насчитывает 112 человек, в том числе 102 научных сотрудника, среди них один член-корреспондент РАН, 24 доктора наук и 51 кандидат наук.
ИИМК РАН ежегодно выпускает два рецензируемых издания: с 1992 г. – «Археологические Вести» и с 2005 г. – «Записки ИИМК РАН». С 2000 г. на базе с Лабораторией археологической технологии института на английском языке публикуется журнал "Radiocarbon and Archaeology". С 2011 г. совместно с Государственным Эрмитажем и С.-Петербургским госуниверситетом издается «Российский археологический ежегодник» (РАЕ).
В Институте действует Диссертационный совет, принимающий к защите диссертации по археологии на соискание ученой степени кандидатов и докторов исторических наук по принятой в России системе квалификации научных кадров и Ph.D. – по квалификации ряда зарубежных стран.
ИИМК РАН, согласно Уставу Института, утвержденному постановлением Президиума РАН от 10.02.1998 г. №39 Вице-президентом РАН академиком Ж.И. Алферовым 23 апреля 1998 г. (зарегистрирован Регистрационной палатой Администрации С.-Петербурга 1 июня 1998 г.), является государственным учреждением в составе РАН.
ИИМК РАН имеет, в соответствии с Федеральным законом «О науке и государственной научно-технической политике» Свидетельство о государственной аккредитации научной организации №546 от 11 сентября 1998 г., выданное Министерством науки и технологий РФ.