В. С. Пугачев систематически участвовал в работе ИФАК. Он был членом Национального комитета СССР по автоматическому управлению при Отделении механики и процессов управления АН СССР, в 1975—1978 гг. был председателем технического комитета ИФАК по математическим проблемам управления, в 1978—1981 гг.— заместителем председателя этого комитета; неоднократно выступал с лекциями в институтах академий наук социалистических стран.

Научная, научно-организационная, педагогическая и общественная деятельность В. С. Пугачёва была по достоинству оценена нашей Родиной. Он заслуженный деятель науки и техники РСФСР, лауреат Ленинской и двух Государственных премий СССР, награжден многими орденами и медалями.

Владимир Семёнович Пугачёв умер 25 марта 1998 года в день своего рождения после тяжелой болезни. Похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище.