геология рудных месторождений, металлогения;
петрология;
минералогия и кристаллохимия;
геохимия;
изотопная геохимия и геохронология;
радиогеология и радиогеоэкология;
геоинформатика;
вулканизм и природные катастрофы;
магматизм и минерагенез дна Мирового океана.
Направления научной деятельности Института соответствуют Программе фундаментальных исследований государственных академий наук на 2008-2012 гг., утвержденной распоряжением Правительства РФ от 27 февраля 2008 г. № 233 - р.