Среди позвоночных Каратау преобладают ганоидные рыбы. Например, птеронискусы (Pteroniscus) (рис. 194) в изобилии населяли мелководья, о чем свидетельствуют массовые скопления их скелетов, иногда в виде валиков, собранных береговым прибоем. Остатки наземных позвоночных обнаруживаются редко. Все они принадлежат животным небольших размеров. Самое крупное из них – сцинкоморфная ящерица шаровизавр (Sharovisaurus karatauensis) с длиной тела около 40 см (рис. 195). Архаичная саламандра караурус (Karaurus sharovi) была вдвое короче (см. рис. 164). Чуть меньшие размеры имели черепахи яксартемисы (Yaxartemys longicauda) (рис. 196) и крокодилы каратаузухи (рис. 187, 188). Остатки крупных наземных позвоночных в отложениях Каратау не обнаружены, но они, несомненно, обитали вблизи берегов древнего озера. Знаменитость местонахождения – небольшой летающий ящер сордес (Sordes pilosus) (рис. 197, 198).