В Институте биологии южных морей имени А.О. Ковалевского РАН впервые в России введён в эксплуатацию новый отечественный полногеномный секвенатор ДНК «Нанофор СПС», разработанный Институтом аналитического приборостроения РАН совместно с компанией «Синтол». Ранее такие установки выпускали только в США и Китае.
Запуск прибора был осуществлён в научно-образовательном центре коллективного пользования «Филогеномика и транскриптомика» научным руководителем ЦКП Екатериной Водясовой, начальником ЦКП Дарьей Игнатьевой и научным директором ООО «НПФ Синтол» Яковом Алексеевым.
«Это полностью российский прибор, с помощью которого выполняется автоматизированное определение последовательности нуклеотидов в цепи ДНК, то есть секвенирования путём синтеза, опять же, на отечественной реагентике. Технология полногеномного секвенирования ДНК на сегодняшний день является наиболее современным подходом для изучения генома биологических объектов. Это открывает большие перспективы для понимания процессов, лежащих в основе функционирования и эволюции живых систем», — отмечает Екатерина Водясова.
«Нанофор СПС» будет использоваться учёными для исследований в области функциональной геномики, токсикологии, иммунологии, физиологии, эволюции, популяционной генетики и др. В частности, он поможет специалистам изучить геномы уникальных гидробионтов из биологической коллекции ФИЦ ИнБЮМ, которая собиралась на протяжении 150 лет, в том числе в ходе кругосветных экспедиций.
«В стенах нашего института уже ведутся научные разработки на основе полногеномного секвенирования, и наличие такого прибора позволит работать эффективнее. К примеру, в ходе выполнения международного проекта с Гвинеей, севастопольскими учёными будет разработана отечественная технология метагеномного анализа бактерий, не уступающая лучшим мировым аналогам. На сегодняшний день мы уже получили первые результаты анализа бактериального разнообразия почв, собранных в 2023 году во время гвинейской экспедиции вдоль русла реки Фатала», — сообщила Дарья Игнатьева.
Отечественный полногеномный секвенатор ДНК «Нанофор СПС» работает в ЦКП «Филогеномика и транскриптомика» ФИЦ ИнБЮМ (Севастополь). Начальник ЦКП прошла стажировку в компании «Синтол» в Москве и готова помочь учёным, желающим освоить область полногеномного, транскриптомного и метагеномного секвенирования;
Прибор приобретён в 2024 году в рамках федерального проекта «Развитие инфраструктуры для научных исследований и подготовки кадров» национального проекта «Наука и университеты».
Источник: ИнБЮМ РАН.