17 мая 2016 года
состоялось очередное заседание Президиума Российской академии наук
Члены Президиума заслушали научное сообщение «Международный проект «Протеом человека» и участие в нем российских ученых».
Докладчик — академик Александр Иванович Арчаков.
Развитие проекта «Геном человека» стало началом международного проекта «Протеом человека», старт которого объявлен 23 сентября 2010 года в Сиднее. Россия не участвовала в выполнении проекта «Геном человека», однако, была одной из шести стран-инициаторов международного протеомного проекта, цель которого более амбициозная — измерить содержание продуктов экспрессии генов (белков) в организме человека. Предполагается, что эти знания откроют новые горизонты в диагностике и лечении заболеваний.
Среди принятых международных сообществом подходов к исследованию протеома, одним из наиболее успешно развивающихся стал хромосомо- или геноцентричный подход, при котором результаты анализа белков картируются на соответствующие им белок-кодирующие гены определенной хромосомы. На сегодняшний день в выполнении проекта участвует более 20 стран (США, Канада, Корея, Китай и др.), усилия которых направлены на измерение белков, кодируемых 25 хромосомами человека (22 соматических, 2 половые хромосомы — Х иY, и митохондриальная хромосома). Российская часть проекта заключается в определении содержания белков, кодируемых генами хромосомы №18 человека, выбранной по оптимальному соотношению количества белок-кодирующих генов (их около 300) и их медицинской значимости.
Согласно утвержденной международным Консорциумом «дорожной карте» проекта, конечной целью российской части является определение размеров протеома хромосомы №18 в трех типах биологического материала — клетках печени человека, клеточной линии гепатоцеллюлярной карциномы HepG2 и плазмы крови. Размер протеома зависит от количества видов белков (ширины протеома) и числа копий каждого вида белка в биологическом образце (глубины протеома). Ширина протеома может быть рассчитана только при учете возможных модификаций белков, т.е. одно-аминокислотных полиморфизмов, вариантов альтернативного сплайсинга и пост-трансляционных модификаций. Для определения глубины протеома «дорожной картой» установлена граница чувствительности используемого аналитического метода — 10-18М, что соответствует 1 копии белка на 107 клеток печени или клеточной линии HepG2 или 1µL плазмы.
В первые пять лет реализации проекта «Протеом человека» за счет использования современных масс-спектрометрических методов российские ученые достигли наилучшей степени охвата белков, кодируемых одной хромосомой.
В обсуждении доклада приняли участие:
ак. В.П. Чехонин, ак. Л.М. Зеленый, ак. М.В. Угрюмов, ак. В.Т. Иванов, ак. А.Л. Асеев, ак. В.А. Черешнев, чл.-корр. А. В Лисица, ак. В.А. Тутельян, ак. А.И. Григорьев.
Члены Президиума обсудили и приняли решения по ряду других научно-организационных вопросов.
Видеозапись заседания