Под руководством Митина Институт философии деградировал. Были уволены все сколько-нибудь способные сотрудники, закрыты четыре отдела из пяти существовавших, свёрнуты все международные контакты. В качестве плановых «изучались» темы вроде: «Сталин как материалист-диалектик» и «Ликвидация кулачества как класса». Основной задачей философов стало обслуживание очередных партийных лозунгов и идеологическая травля неугодных учёных.
В 1934 г. с введением учёных степеней М.Б. Митину без защиты диссертации была присуждена степень доктора философских наук, годом ранее присвоено учёное звание профессора.
Выполнением партийного задания новым руководством института стало создание в 1933–1934 гг. учебника «Диалектический и исторический материализм» под редакцией Митина. В учебнике давался предельно догматизированный вариант марксизма, а Сталин возводился в ранг величайшего философа. Теоретический уровень учебника не мог не быть низким. Ровно треть учебника была отведена не вопросам философской теории, а «борьбе на два фронта в философии». Стилистика здесь отличалась совершенной разнузданностью. Однако авторы учебника в приступе чрезмерного усердия слишком подробно ругали оппозиционеров. Поэтому в 1936 г. цензор Главлита в письме к Сталину признал учебник политически непригодным и вредным. Митин был первым, кто сразу же выступил с осуждением учебника, вышедшего под его же редакцией. Больше половины авторов учебника были репрессированы. Сам Митин – циник и карьерист – не верил ни во что, в том числе и в марксизм, используя который продвигался к высотам власти.
Он был одним из главных организаторов репрессий против советских философов. На его счету десятки, сотни загубленных жизней талантливых людей. Те, кого он в своих статьях называл вредителями, немедленно арестовывались. Массовые репрессии прошли в Институте философии. Весь первый, деборинский, состав сотрудников был уничтожен, в том числе по доносам Митина. Сотрудники, работавшие у него в подчинении, не были уверены в своём будущем.
В 1936 г. в последний раз был арестован Я.Э. Стэн. Стэном для 57-го тома «Большой советской энциклопедии» была написана обширная статья «Философия». После ареста Стэна Митин присвоил рукопись, опубликовал статью за своей подписью, добавив абзац, в котором назвал подлинного автора статьи идеологом «антипартийной и антисоветской террористической деятельности троцкистско-зиновьевской банды».
Выступая в 1937 г. на общем собрании сотрудников института, Митин требовал разоблачить «троцкистско-фашистских агентов и вредителей на идеологическом фронте в нашем Институте». Он хвалился достигнутыми в этом деле успехами, называя фамилии арестованных, среди которых был его друг Ральцевич, помогший ему в расправе с деборинцами. Когда жена арестованного философа И.Я. Вайнштейна пришла в комнату дирекции и обратилась к восседавшему там Митину за помощью, он, узнав, кто она такая, «с нескрываемо злым и холодным выражением лица сказал: “Без несомненной вины у нас никого не арестовывают. Я ничем не могу помочь”. И, посмотрев на часы, встал, давая понять, что ему некогда». «Я возразила, – вспоминала жена Вайнштейна, – что он ведь много лет знает Вайнштейна, что тот всегда был марксистом-ленинцем. Резко оборвав меня, Митин буквально закричал, чтобы я немедленно, сию секунду покинула его кабинет, иначе он вызовет милицию и меня уведут куда следует… Не имея сил сдержать рыдания, я вышла».
