В 1902 г. А.А. Скочинский стал не только ассистентом, а затем преподавателем ПГИ на кафедре горного искусства (до 1906 г.), но и одновременно учёным секретарём и членом Комиссии по борьбе со взрывами газов и угольной пыли в угольных шахтах России (до 1917 г.). Он обследовал 14 рудников Домбровского бассейна (Польша) для выяснения состояния проветривания копей и степени опасности их в отношении гремучего газа и пыли (1904). К 1905 г. Скочинский собрал достаточное количество материала и представил свою работу «Рудничный воздух и основной закон движения его по рудничным выработкам» в ПГИ в качестве диссертационной. В ней выдвинуты теоретические положения, на основе которых позже строилась рудничная аэродинамика. Работа была утверждена, а её автор получил звание адъюнкт-профессора и стал в 1906 г. профессором кафедры горного искусства (1908–1915 – экстраординарный; 1915–1917 – ординарный). На кафедре Скочинский создал курсы по специальным предметам: рудничное проветривание; рудничное крепление, доставка и откатка; подземные пожары; горноспасательное дело. Он организовал специальную лабораторию по рудничной вентиляции и горноспасательному делу.
В годы работы в ПГИ А.А. Скочинский участвовал в Первом съезде деятелей горного дела, металлургии и машиностроения (1910, Екатеринославль); в Международном конгрессе по вопросам, касающимся подачи первой помощи и спасения при несчастных случаях (1908, Франкфурт-на-Майне, Германия). Работа рудничной секции этого конгресса, членом которой он был, посвящалась вопросам постановки спасательного дела при горных работах (в частности, при взрывах и пожарах). Позже профессор – почетный председатель рудничной секции Международного конгресса по вопросам, касающимся подачи первой помощи и спасения при несчастных случаях (1913, Вена, Австро-Венгрия).
В 1917 г. Скочинский был командирован горным департаментом в составе специальной комиссии в Донбасс для выяснения добычной способности и перспективы добычи в этом бассейне на ближайшие 3–5 лет. В Новочеркасске он стал ординарным профессором Донского политехнического института (1917–1920).
