В философии М.Б. Митин ничем себя не проявил и придерживался общепринятых тогда позиций. В статье «Ленин и философия» он дал восторженный отзыв на книгу тогдашнего лидера советской философии А.М. Деборина «Ленин как мыслитель»: «Популярная, написанная живым языком, – писал Митин о книге Деборина, – она является лучшим изложением философских взглядов Ленина, а тем самым и диалектического материализма. В богатой по количеству литературе по ленинизму эта брошюра т. Деборина выгодно отличается по своему качеству». Впоследствии эту статью Митин не включал в свою официальную библиографию.
В конце 1929 г. ситуация кардинально изменилась. Сталин окончательно разгромил оппозиционные течения в партии; началось утверждение его монополии, насаждение культа его личности во всех сферах духовной жизни. В числе первых жертв сталинизации оказалась философия. А.М. Деборин отказался от сделанного ему из ЦК предложения написать статью, в которой Сталин провозглашался бы великим философом-классиком марксизма. С начала 1930 г. структуры ЦК начали систематическое давление на А.М. Деборина и представителей его школы – «диалектиков». Было запрещено проведение Всесоюзной философской конференции, отказано в разрешении издавать журнал «Проблемы философии», «спущен на тормозах» вопрос о поездке делегации Института философии во главе с А.М. Дебориным в Оксфорд на Международный философский конгресс.
В этот же период среди выпускников ИКП были найдены люди, которые стали организованно выступать против Деборина и его сторонников (П.Ф. Юдин, В.Н. Ральцевич, Ф.В. Константинов, М.Д. Каммари и др.). Их лидером и стал М.Б. Митин. Действия этой группы координировались Агитпропом ЦК и специально делегированным для этого Е.М. Ярославским. Первый бой существующего и будущего, рвавшегося к власти философского руководства прошёл на совместном заседании партийных фракций Института философии Коммунистической академии и московской организации Общества воинствующих материалистов-диалектиков, проходившем 20–24 апреля 1930 г. В своём заключительном слове на совещании А.М. Деборин отметил, что новая группа стремится к власти и дискредитирует философское руководство.
Заведующий Агитпропом ЦК А.И. Стецкий позвонил А.М. Деборину домой и заявил, что теперь следует утвердить один авторитет во всех науках – Сталина. После этого Митин, Юдин и Ральцевич явились на квартиру Деборина. Деборин так вспоминал об этом визите: они «предъявили мне ультиматум: на публичном собрании я должен был разгромить своих учеников, объявив их врагами народа. Самого же Сталина провозгласить великим философом. Хорошо зная, чем я рискую, всё же категорически отказался от выполнения этого приказа. После моего отказа последовала бешеная атака на меня и моих единомышленников. Особенно дико действовал М.Б. Митин, не останавливавшийся перед самой дикой клеветой». Е.Г. Плимак, работавший в 1950-х гг. референтом А.М. Деборина, точнее передаёт его ответ несвятой троице: «Я не предаю своих учеников и друзей».
