1. Южная боковая абсида собора Пантелеймонова монастыря; 2. Древний пол собора и основание алтарной преграды; 3. Пол собора и средняя абсида;

4. Средняя абсида и фундамент северной абсиды; 5. Фрески собора Пантелей-монова монастыря. Начало XIII в.; 6. Общий вид раскрытых конструкций собора. Вид с юго-запада; 7. Северная стена собора и основание северной абсиды;

8. Ладьевидный саркофаг и плита над плинфяным саркофагом

После этого храм перестраивался в 1370-е гг. К XVII в. он разрушился, а потому его выстроили из дерева. Новый храм на том же месте, уже вместо деревянного, был сооружен в начале XIX столетия. Он простоял до 1930-х гг., когда был разобран. Еще почти полвека спустя ленинградский археолог Павел Александрович Раппопорт открыл часть здания 1207 г.; результаты этих раскопок были опубликованы. После этих раскопок место монастыря и древнего каменного храма было практически забыто, так что пришлось заново разыскивать развал древних строительных материалов, обозначающий местоположение средневековой обители.

В Пантелеймонове монастыре раскопками открыты основания монастырского собора 1207 г. Это был небольшой четырехстолпный одноглавый трехабсидный храм, стены и столбы которого был сложены из плитняка и плинфы на известково-цемяночном растворе. Западная стена храма была утолщена для устройства в ее пространстве внутристенной лестницы. Перед западной стеной выдавался небольшой притвор. Полы храма были устроены в виде заливки известково-цемяночного раствора. Храм был расписан, собрано огромное количество фрагментов фресок, один участок росписи уцелел в нижней части стены.

После перестройки храма в 1370-е гг. он стал одноабсидным, столбы и стены нового здания были поставлены на стены старого храма. С запада вместо старого притвора был построен новый, широкий притвор.